Las siguientes son las enfermedades o complicaciones más importantes a las que puede contribuir la enfermedad de manos, pies y boca (HFMD):
Piel y subcutáneo (L00-L99).
- Onicólisis (desprendimiento parcial de la placa ungueal del lecho ungueal) u onicomadesis (desprendimiento completo de la placa ungueal del lecho ungueal) - en cursos atípicos: pérdida de las uñas y uñas de los pies (generalmente dentro de las cuatro semanas posteriores a la infección).
Psique - sistema nervioso (F00-F99; G00-G99).
- Encefalitis (inflamación del cerebro), aséptico (muy raro).
- Meningitis (meningitis), aséptico (muy raro).
- Paresia (parálisis), similar a la poliomielitis.